使得多特蒙德成为欧洲足坛一股不容忽视的强大力量，球队也在01/02赛季再次夺得德甲冠军。
2000年10月31日俱乐部在法兰克福证券交易所上市。2001年萨默尔开始执教多特蒙德。俱乐部花费一亿四千万马克买来罗西基、科勒、阿莫鲁索，其中阿莫鲁索的转会费两千五百万欧元是当时德国俱乐部转会费的最高记录，次年俱乐部夺冠。
盛极必衰是永恒的规律，由于球队管理层挥霍无度引进大牌球星，导致俱乐部入不敷出欠下一点二五亿英镑债务，财政状况日益恶化，已经有近百年历史的多特蒙德俱乐部逐渐走向低谷。
2005年俱乐部甚至已经到了破产边缘，对成功的渴望却让曾经的德甲豪门到了穷困潦倒、濒临倒闭的地步，同上世纪90年代后期的鼎盛时期相比，球队几近崩溃。2005-2008年是俱乐部历史上最为艰难的时期，虽然俱乐部决心要让已经病入膏肓的病人重新复活，但窘困的财政状况一直没有好转。
主教练也很有野心，但是他的愿望常常由于俱乐部糟糕的经营状况而不能实现;球迷们总是期待着球队的成功，但他们也只能情不自愿的习惯于球队在德甲中游的成绩，俱乐部为了平衡财政做出了一系列大清洗，导致球队一直只能在联赛积分榜中游徘徊。
当托马斯-多尔在07-08赛季率队拿到20年来球队的联赛最差战绩第十三名后，看似多特蒙德会就这样沉沦下去，再无抬头之日。
不过2008年被看作是大黄蜂重生的纪元年，08年夏天新的营运团队进驻，也带来了节省支出，增加商业活动的新理念，在经历了多尔带队的失败后，董事明白，他们真正需要的是一位能不断激励球队及球迷，一位能让俱乐部恢复往日声望的帅才。
他们选择了尤尔根·克洛普，一位刚刚带领美因茨历史性地冲入德甲并广受外界褒奖的少帅。他手下球队华丽而又不失严谨的球风得到了德国足球界的诸多夸赞，带着要重现多特蒙德昔日辉煌的承诺，克洛普得到了最初的两年合同。克洛普心中自然明白，要想在多特有所作为，他必须运用一套不会让俱乐部再陷债务泥潭的运营体系。
克洛普的球员生涯大部份时间在美因茨度过，由1990年效力到2001年退役，期间球队一直位于德乙的中游位置，克洛普初期担任前锋，于1995/96赛季开始移后成为一名后卫。
退役后克洛普留在美因茨担任主教练，执教长达八年。首两年即带领球队冲击升级资格，
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